Marine Systems hecht veel waarde aan de kwaliteit van haar diensten en producten. Minstens zo belangrijk is dat de werkzaamheden op een veilige en milieubewuste uitgevoerd worden. Marine Systems hanteert daarom zowel een kwaliteitsmanagementsysteem als een veiligheids-, gezondheids-, welzijn, en milieu systeem. Beide systemen zijn getoetst door certificerende instanties. Marine Systems beschikt over de volgende certificaten:
- VCA*;
- ISO9001;
- ISO14001;
- CO² prestatieladder, niveau 5.
Marine Systems streeft er naar het kwaliteitsmanagementsysteem en het veiligheids-, gezondheids, welzijn, en milieu systeem continu te verbeteren. Alle medewerkers leveren een actieve bijdrage bij het hanteren en verbeteren van deze systemen.